Konkurs na stanowiska stypendysty w Zakładzie Biotechnologii Roślin w ramach realizacji projektu badawczego finansowanego z środków programu SONATA17 NCN pt. „Znaczenie polisacharydów w zamieraniu jesionu wyniosłego (Fraxinus excelsior L.). (2021/43/D/NZ9/01978). Termin nadsyłania zgłoszeń upływa 19 grudnia 2022 r.

Stanowisko: stypendysta

Liczba stypendiów: 2

Miejsce realizacji projektu: Zakład Biotechnologii Roślin, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, Uniwersytet Jagielloński

Kierownik projektu: dr Jan Łyczakowski

Źródło finansowania: Narodowe Centrum Nauki, program SONATA17

Termin przyjmowania zgłoszeń: 19 grudnia 2022, godz. 15:00

Wynagrodzenie: 2000 PLN/m-c

Data rozpoczęcia: styczeń 2023

Opis projektu:

Zamieranie jesionu wyniosłego jest jednym z głównych problemów ekologicznych na naszym kontynencie. W niektórych lasach ponad 80% drzew tego gatunku umrze z powodu tej choroby. Zamieranie jesionu spowodowane jest przez patogen grzybiczy o łacińskiej nazwie Hymenoscyphus fraxineus. Od czasu pierwszych obserwacji zamierania jesionów w polskich lasach, poznano wiele procesów biologicznych związanych z chorobą tego gatunku, jednak ich molekularne podstawy wciąż pozostają nie do końca zbadane. W szczególności, nie wiemy jak ściany komórkowe - wielocukrowe osłony chroniące komórki jesionu przed infekcją, są degradowane przez patogen, co umożliwia rozrost komórek grzybiczych w tkankach jesionu. Ponadto, nie wiemy czy i w jaki sposób komórki jesionu identyfikują fragmenty patogenu grzybiczego oraz czy ta identyfikacja umożliwia uruchomienie odpowiedzi ochronnych w roślinie. Uzyskanie odpowiedzi na te pytania umożliwiłoby opracowanie nowych sposobów doboru osobników jesionu odpornych na zamieranie. To może umożliwić zachowanie tego cennego gatunku w europejskich lasach. 

Wymagania:

Dla obu pozycji stypendialnych niezbędnie jest spełnianie wymogów formalnych przewidzianych w regulaminie przyznawania stypendiów naukowych NCN w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki. W szczególności, niezbędne jest aby stypendysta/ stypendystka spełniał jedno z poniższych kryteriów:

a) jest studentem studiów: pierwszego stopnia, drugiego stopnia lub jednolitych studiów magisterskich, realizowanych w uczelniach na terytorium Polski;

b) jest uczestnikiem studiów doktoranckich

c) jest doktorantem w szkole doktorskiej

Dla stypendysty 1 dodatkowe wymagania, w związku z realizacją zadań badawczych, to:

- Podstawowa wiedza z zakresu biologii i biochemii polisacharydów;

- Doświadczenie w technikach biologii molekularnej takich jak izolacja DNA, klonowanie i transformacja bakterii;

- Doświadczenie w izolacji RNA, najlepiej z materiału roślinnego;

- Dobra znajomość zasad bezpiecznej i dokładnej pracy laboratoryjnej i zarządzania danymi badawczymi;

- Bardzo dobra znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie;

Dla stypendysty 2 dodatkowe wymagania, w związku z realizacją zadań badawczych, to:

- Podstawowa wiedza z zakresu biologii i biochemii polisacharydów;

- Doświadczenie w hodowlach mikrobiologicznych i przygotowaniu pożywek mikrobiologicznych;

- Zaletą będzie pewne doświadczenie z izolacją RNA i/lub analizą wyników z eksperymentów RT-qPCR;

- Zaletą będzie znajomość technik bioinformatycznych związanych z analizą genomów i identyfikacją genów;

- Dobra znajomość zasad bezpiecznej i dokładnej pracy laboratoryjnej i zarządzania danymi badawczymi;

- Bardzo dobra znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie;

Opis zadań:

Osoba wybrana na stanowisko stypendysty 1 będzie odpowiedzialna za realizację następujących zadań:

- przygotowanie próbek polisacharydów ściany komórkowej z drewna i liści jesionu wyniosłego;

- izolacja RNA i profilowanie ekspresji genów jesionu wyniosłego;

- przygotowanie plazmidów do modyfikacji genetycznej jesionu wyniosłego oraz wykonywanie transformacji jesionu;

- pasażowanie kalusa jesionu wyniosłego niezbędnego do transformacji;

Osoba wybrana na stanowisko stypendysta 2 będzie odpowiedzialna za realizację następujących zadań:

- przygotowanie odpowiednich pożywek i hodowla grzyba Hymenoscyphus fraxineus;

- udział w pracach związanych z infekcją kalusa jesionu wyniosłego grzybem H. fraxineus;

- analiza polisacharydów wydzielanych oraz tych tworzących ścianę komórkową H. fraxineus;

- udział w identyfikacji i profilowaniu ekspresji genów kodujących hydrolazy glikozydowe H. fraxineus;

Procedura rekrutacyjna:

Zgłoszenia/zapytania należy przesyłać drogą elektroniczną pod adres: jan.lyczakowski@uj.edu.pl z dopiskiem w tytule maila SONATA17 Stypendysta 1 lub SONATA17 Stypendysta 2. Zgłoszenie powinno zawierać:

- podanie (list motywacyjny);

- CV z uwzględnieniem dorobku naukowego, pozwalające ocenić umiejętności kandydata/kandydatki w związku z planowanymi zadaniami badawczymi;

- potwierdzenie/oświadczenie o spełnianiu wymogów formalnych wynikających z regulaminu przyznawania stypendiów;

Do dokumentu należy dołączyć oświadczenie: „Wyrażam zgodę na przetwarzanie danych osobowych zawartych w mojej ofercie pracy na potrzeby niezbędne do przeprowadzenia procesu rekrutacji prowadzonego przez Zakład Biotechnologii Roślin WBBiB UJ, zgodnie z art. 13 ust. 1 i 2 rozporządzenia (UE) 2016/679 Parlamentu i Rady z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w zakresie przetwarzania danych osobowych i swobodnego przepływu tych danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46 / WE (RODO)”.

Warunki zatrudnienia:

Oferujemy możliwość pracy w aktywnym zespole badawczym zajmującym się wieloma tematami związanymi z biochemią i biologią polisacharydów. Stypendyści będą mieli możliwość rozwoju zawodowego przez poznanie nowych technik badawczych. Stypendyści będą współautorami prac badawczych wynikających z prowadzonych przez nich badań. Oferowane jest stypendium w wysokości 2000 PLN/miesiąc dla każdego z wybranych stypendystów.

Rozstrzygnięcie konkursu nastąpi do dnia 21 grudnia 2022.