dr hab Wojciech Strzałka, kierownik zakładu

 

pokój: B242 (3.1.33)

Zainteresowania badawcze

regulacja cyklu komórkowego, replikacja i naprawa DNA, biotechnologia roślin, biotechnologia medyczna, wykorzystanie aptamerów DNA w biotechnologii/biologii molekularnej

Nagrody i granty

2020-2023   Projekt OPUS17 finansowany przez NCN (kierownik) „Analiza funkcji izoform roślinnego białka FEN1 oraz ich fosforylacji z wykorzystaniem modelu doświadczalnego Arabidopsis thaliana"

2015-2018   Projekt Tango finansowany przez NCBR (kierownik) „Opracowanie, charakterystyka i optymalizacja innowacyjnych aptamerów DNA przeznaczonych do oczyszczania białek rekombinowanych"

2014-2019   Projekt Sonata-Bis finansowany przez NCN (kierownik) „Charakterystyka funkcji roślinnych białek PCNA1 i PCNA2 z wykorzystaniem modelu doświadczalnego Arabidopsis thaliana" 

2011-2014   Projekt LIDER finansowany przez NCBiR, (kierownik), „Poszukiwanie  nowoczesnego leku przeciwnowotworowego opartego na inhibitorach białka  PCNA"

2011-2014   Projekt finansowany przez MNiSW, (kierownik) „Analiza sieci oddziaływań pomiędzy roślinnym białkiem PCNA a wybranymi białkami zaangażowanymi   w regulację cyklu komórkowego u roślin"

2010-2013   Projekt finansowany przez MNiSW (kierownik), „Analiza molekularna PCNA Arabidopsis thaliana"

2008             Stypendium Europejskiej Fundacji Canona

2008             Nagroda Rektora UJ.

Publikacje

1. Eckstein A, Grzyb J, Hermanowicz P, Zgłobicki P, Łabuz J, Strzałka W, Dziga D, Banaś AK. Arabidopsis phototropins participate in the regulation of dark-induced leaf senescence. International Journal of Molecular Sciences (2021), 22(4), 1836; 
2. Łabuz J, Sztatelman O, Jagiełło-Flasińska D, Hermanowicz P, Bażant A, Banaś AK, F, Giza A, Kozłowska A, Lasok H, Sitkiewicz E, Krzeszowiec W, Gabryś H, Strzałka W. Phototropin interactions with SUMO proteins. Plant and Cell Physiology, pcab027, 
3. Strzałka W, Zgłobicki P, Kowalska E, Bażant A, Dziga D, Banaś AK. The Dark Side of UV-Induced DNA Lesion Repair. Genes (Basel). 2020 Dec 2;11(12):1450. doi: 10.3390/genes11121450. PMID: 33276692; PMCID: PMC7761550.
4. Banaś AK, Zgłobicki P, Kowalska E, Bażant A, Dziga D, Strzałka W. All You Need Is Light. Photorepair of UV-Induced Pyrimidine Dimers. Genes (Basel). 2020 Nov 4;11(11):1304. doi: 10.3390/genes11111304. PMID: 33158066; PMCID: PMC7694213.
5. Kowalska E, Strzalka W, Takuji O 2020 A crystallization and preliminary X-ray diffraction study of the Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen (PCNA2) alone and in complex with a PIP-box peptide from Flap endonuclease 1. Acta Biochimica Polonica Vol 67(1): 49-52
6. Antosiak A, Tokodi N, Maziarz R, Kokociński M, Brzozowska A, Strzałka W, Banaś A.K, Willis A, Dziga D 2020 Different gene expression response of polish and australian Raphidiopsis raciborskii strains to the chill/light Stress. Applied Science 10, 5437
7. Kuczyńska P, Jemioła-Rzemińska M, Nowicka B, Jakubowska A, Strzałka W, Burda K, Strzałka K 2020 The xanthophyll cycle in diatom Phaeodactylum tricornutum in response to light stress. Plant Physiology and Biochemistry 152: 125-137 
8. Brown P, RELISH Consortium and Zhou Y  2019 Large expert-curated database for benchmarking document similarity detection in biomedical literature search Database Volume 2019, 2019, baz085
9. Dziga D, Tokodi N, Drobac D, Kokocinski M, Antosiak A, Puchalski J, Strzałka W, Madej M, Svirˇcev Z and Meriluoto J 2019 The Effect of a Combined Hydrogen Peroxide-MlrA Treatment on the Phytoplankton Community and Microcystin Concentrations in a Mesocosm Experiment in Lake Ludoš Toxins 11, 725; doi:10.3390/toxins11120725
10. Dziga D, Kokociński M, Barylski J, Nowicki G, Maksylewicz A, Antosiak A, Banaś AK, Strzałka W, Correlation between specific groups of heterotrophic bacteria and microcystin biodegradation in freshwater bodies of central Europe, FEMS Microbiology Ecology (2019) 95(11), 
11. Olchawa-Pajor M, Bojko M, Strzałka W, Strzałka K, Latowski D. Violaxanthin conversion by recombinant diatom and plant de-epoxidases, expressed in Escherichia coli – comparative analysis. Acta Biochimica Polonica (2019), 66(3): 249-255, https://doi.org/10.18388/abp.2019_2831
12. Kowalska E, Bartnicki F, Fujisawa R, Bonarek P, Hermanowicz P, Tsurimoto T, Muszyńska K, Strzalka W 2018. Inhibition of DNA replication by an anti-PCNA aptamer/PCNA complex. Nucleic Acid Research 46:25-41.
13. Banaś AK, Hermanowicz P, Sztatelman O, Łabuz J, Aggarwal Ch, Zgłobicki P, Jagiełło-Flasińska D, Strzałka W 2017. 6,4 - PP Photolyase Encoded by AtUVR3 is Localized in Nuclei, Chloroplasts and Mitochondria and Its Expression is Down-Regulated by Light in a Photosynthesis-Dependent Manner. Plant and Cell Physiology. pcx159, https://doi.org/10.1093/pcp/pcx159
14. Muszyńska K, Ostrowska D, Bartnicki F, Kowalska E, Bodaszewska-Lubaś M, Hermanowicz P, Faulstich H, Strzałka W 2017. Selection and analysis of a DNA aptamer binding α-amanitin from Amanita phalloides. Acta Biochimica Polonica 64:401-406.
15. Dziga D, Zielinska G, Władyka B, Bocheńska O, Maksylewicz A, Strzałka W, Meriluoto J 2016. Characterization of enzymatic activity of MlrB and MlrC proteins involved in bacterial degradation of cyanotoxins microcystins. Toxins, 8(3): 76.
16. Sztatelman O, Łabuz J, Hermanowicz P, Banaś AK, Bażant A, Zgłobicki P, Aggarwal Ch, Nadzieja M, Krzeszowiec W, Strzałka W, Gabryś H 2016. Fine tuning chloroplast movements through physical interactions between phototropins. Journal of Experimental Botany, doi: 10.1093/jxb/erw265
17. Gabruk M, Stecka A, Strzałka W, Kruk J, Strzałka K, Mysliwa-Kurdziel B 2015. Photoactive protochlorophyllide-enzyme complexes reconstituted with PORA, PORB and PORC proteins of A. thaliana: fluorescence and catalytic properties. PLoS One 10(2): e0116990. doi:  10.1371/journal.pone.0116990.
18. F. Bartnicki, E. Kowalska, K. Pels, W. Strzalka. 2015. Imidazole-free purification of His3-tagged recombinant proteins using ssDNA aptamer-based affinity chromatography. 2015. Journal of  Chromatography A 1418:130-9.
19. W. Strzałka, C. Aggarwal C, W. Krzeszowiec, A. Jakubowska, O. Sztatelman, A.K. Banaś 2015. Arabidopsis PCNAs form complexes with selected D-type cyclins. Frontiers in Plant Science 6:516.
20. J. Rydzewski J, W. Strzałka, W. Nowak. 2015. Nanomechanics of PCNA: A protein-made DNA sliding clamp. Chemical Physics Letters 634:236–242.
21. E. Kowalska, F. Bartnicki, K. Pels, W. Strzalka. The impact of immobilized metal affinity chromatography (IMAC) resins on DNA aptamer selection. 2014. Analytical Bioanalytical Chemistry 406(22): 5495–5499.
22. M. Bojko, M. Olchawa-Pajor, U. Tuleja, P. Kuczyńska, W. Strzalka, D. Latowski, K. Strzalka. 2013.  Expression of three diadinoxanthin de-epoxidase genes of Phaeodacylum tricornutum in Escherichia coli Origami b and BL21 strain.2013. Acta Biochimca Polonica 60(4):857-860.
23. W. Strzalka, C. Aggarwal. Arabidopsis thaliana Proliferating Cell Nuclear Antigen 1 and 2 possibly form homo- and hetero-trimeric complexes in the plant cell. (Invited manuscript). Plant Sign & Behavior 7 (8) e24837.1-e24837.3.
24. W. Strzałka, F. Bartnicki, K. Pels K, A. Jakubowska, T. Tsurimoto, K. Tanaka. 2013. RAD5a ubiquitin ligase is involved in ubiquitination of Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antygen. Journal of Experimental Botany 64(4): 859-869.
25. W. Strzałka, C. Aggarwal. 2013. Arabidopsis thaliana: Proliferating cell nuclear antigen 1 and 2 possibly form homo- and hetero-trimeric complexes in the plant cell. Plant Signaling & Behavior 8(7): e 24837.
26. W. Strzalka, P. Labecki, F. Bartnicki, C. Aggarwal, M.  Rapala-Kozik, C. Tani, K. Tanaka, H. Gabrys. 2012. Arabidopsis thaliana Proliferating Cell Nuclear Antigen has several potential sumoylation sites. Journal of Experimental Botany 63: 2971-83.
27. W. Strzalka, A. Ziemienowicz 2011. Proliferating cell nuclear antigen (PCNA): a key factor in DNA replication and cell cycle regulation. (Invited review), Annals of Botany 107: 1127-1140.
28. W. Strzalka, A. Kaczmarek, B. Naganowska and A. Ziemienowicz. 2010. Identification and functional analysis of PCNA1 and PCNA-like1 genes of Phaseolus coccineus. Journal of Experimental Botany 61: 873–888.
29. W. Strzalka, T. Oyama, K. Tori and K. Morikawa. 2009. Crystal structures of the Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen 1 and 2 proteins complexed with the human p21 C-terminal segment. Protein Science 18:1072-1080. 
30. B. Nowicka, W. Strzalka, K. Strzalka. 2009. New transgenic line of Arabidopsis thaliana with partly disabled zeaxanthinxepoxidase activity displays changed carotenoid composition, xanthophyll cycle activity and nonphotochemical quenching kinetics. Journal of Plant Physiology 166:1045-56.
31. Strzalka W. and A. Ziemienowicz. 2007. Molecular cloning of Phaseolus vulgaris cDNA encoding proliferating cell nuclear antigen. Journal of Plant Physiology 164:209-213.
32. M. Mizianty, W. Bieniek, A. Czech, W. Strzalka and M. Szklarczyk. 2005. Variability and structure of natural populations of Elymus caninus (L.) L. and their possible relationship with Hordelymus europaeus (L.) Jess. ex Harz as revealed by AFLP analysis. Plant Systematics and Evolution 256:193-200.
33. A. Sabat, J. Krzyszton-Russjan, W. Strzalka, R. Filipek, K. Kosowska, W. Hryniewicz, J. Travis, J. Potempa. J. 2003. A new method for typing of Staphylococcus aureus strains: Multiple-locus variable number tandem repeat analysis of polymorphism and genetic relationships of clinical isolates. Journal of Clinical Microbiology 41(4):1801-4.